La Direction des Etablissements Privés d’Enseignement Supérieur (DEPES) est chargée :
 de définir les règles de contrôle des établissements privés de l’enseignement supérieur ;
 d’élaborer les règles d’ouverture et de fermeture des établissements ainsi que celles des sections et des filières dans l’enseignement supérieur privé, en collaboration avec la direction de la programmation et de la prospective ;
 de veiller à la qualité du contenu des enseignements dans ces établissements et à celle du personnel enseignant ;
 de veiller au respect des différents engagements pris par les promoteurs d’établissement supérieur privé vis-à-vis du ministère en charge de l’enseignement supérieur, des enseignants et des étudiants ;
 d’organiser périodiquement des visites de contrôle dans les établissements privé d’enseignement supérieur ;
 de veiller à l’archivage et à la conservation des dossiers ;
 de recueillir et d’analyser les données statistiques relatives à l’enseignement privé.

La Direction des Etablissements Privés d’Enseignement Supérieur (DEPES) comprend :
 un service administratif et financier ;
 un service du suivi et de contrôle ;
 un service des statistiques et de la documentation.